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晶體學(xué)是一門研究晶體結(jié)構(gòu)概念與晶體性質(zhì)、晶體制備及其應(yīng)用的學(xué)科,是自然科學(xué)中的基礎(chǔ)學(xué)科。而XRD識別晶體的過程就是晶體學(xué)中的關(guān)鍵步驟之一。美國晶體XRD數(shù)據(jù)庫(CSD)是世界上更受歡迎和廣泛使用的晶體數(shù)據(jù)資源之一。本文將對美國晶體XRD數(shù)據(jù)庫進行全面解析,讓讀者更加深入地了解這一數(shù)據(jù)資源。

一、CSD簡介
美國晶體XRD數(shù)據(jù)庫是由劍橋晶體學(xué)數(shù)據(jù)中心(CCDC)創(chuàng)建的一組數(shù)據(jù)資源之一,是一款全球獨立的化學(xué)信息產(chǎn)品。CSD包含了全球范圍內(nèi)有機晶體結(jié)構(gòu)的完整記錄,旨在促進對有機化合物晶體結(jié)構(gòu)的理解、分析和使用,為化學(xué)家、材料科學(xué)家、計算機模擬研究人員等相關(guān)人員提供數(shù)據(jù)資源支持。
作為包含有超過晶體學(xué)標準100萬組記錄的數(shù)據(jù)庫,CSD是研究、識別、探索晶體結(jié)構(gòu)的必備工具,被廣泛應(yīng)用于物理化學(xué)、藥物設(shè)計、工業(yè)催化和生物醫(yī)學(xué)等多個領(lǐng)域。
二、CSD的基本構(gòu)成
1. 數(shù)據(jù)庫總覽:總覽界面包括CSD完整記錄的檢索和篩選功能,并提供鏈接到詳細數(shù)據(jù)和圖像的功能。
2. 元素篩選:CSD支持多種元素篩選,可自由選擇篩選元素并進行多維度的篩選。
3. 數(shù)據(jù)交互:CSD提供數(shù)據(jù)交互功能,包括化學(xué)目錄創(chuàng)作、晶體結(jié)構(gòu)可視化和訪問化學(xué)護城河。
4. 數(shù)據(jù)分析:CSD支持多種數(shù)據(jù)分析方法,如結(jié)晶統(tǒng)計分析、變分法、高通量篩選等。
三、CSD的應(yīng)用
1.結(jié)構(gòu)篩選應(yīng)用
CSD支持基于元素、分子結(jié)構(gòu)等科學(xué)原理的數(shù)據(jù)篩選,為化學(xué)家、藥學(xué)家等研究人員提供了快速、高效和準確的結(jié)構(gòu)篩選工具,可用于晶體結(jié)構(gòu)的研究和理解。
2.假結(jié)構(gòu)檢驗
CSD具有廣泛的假結(jié)構(gòu)檢驗?zāi)芰?,它具有多種檢驗方法和工具,可為科學(xué)研究工作者提供準確和可靠的晶體結(jié)構(gòu)判斷。
3.晶體設(shè)計
CSD不僅對已知的晶體結(jié)構(gòu)進行了整理,而且還提供了一系列晶體設(shè)計工具,例如晶體構(gòu)效關(guān)系分析、晶體制備條件預(yù)測等,可協(xié)助科研工作者進行晶體設(shè)計研究。
四、應(yīng)用案例
1. 晶體學(xué)研究
CSD在晶體學(xué)研究領(lǐng)域的應(yīng)用非常廣泛,可以在結(jié)晶學(xué)中識別新的晶體結(jié)構(gòu),提高晶體結(jié)構(gòu)解析的準確性和速度。CSD也廣泛應(yīng)用于化學(xué)合成、醫(yī)藥領(lǐng)域和動物學(xué)研究等多個領(lǐng)域,為相關(guān)研究人員提供了堅實的數(shù)據(jù)支持。
2. 新材料開發(fā)
在新材料開發(fā)領(lǐng)域,CSD可以對新材料進行晶體結(jié)構(gòu)識別,優(yōu)化他們的結(jié)構(gòu)與性能關(guān)系,支持物質(zhì)的性質(zhì)模擬,解決材料制備、結(jié)構(gòu)和性能之間的關(guān)系問題。CSD可以更有效地協(xié)助材料設(shè)計研究實現(xiàn)深入。
3. 藥物開發(fā)
CSD可以用來識別藥物晶體結(jié)構(gòu),并協(xié)助藥物開發(fā)人員尋找藥物與DNA、蛋白質(zhì)等生物大分子點的聯(lián)系。CSD還可以協(xié)助藥物合成與晶體的設(shè)計與制備,優(yōu)化藥物的性質(zhì)和效能關(guān)系。CSD將成為未來藥物開發(fā)領(lǐng)域的重要工具。
五、CSD的未來
CCDC一直在致力于升級和擴展CSD,計劃將精簡但全面的專業(yè)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫融入CSD,為自然科學(xué)和其他廣泛領(lǐng)域的研究人員提供更多的晶體解析資源和幫助,同時創(chuàng)造更強有力的國際化晶體學(xué)研究平臺。
美國晶體XRD數(shù)據(jù)庫是重要的晶體數(shù)據(jù)庫資源之一,具有廣泛的應(yīng)用前景。CCDC不斷更新CSD,嘗試更好地服務(wù)于化學(xué)家、物理學(xué)家、生物學(xué)家、醫(yī)學(xué)家和相關(guān)研究人員,發(fā)揮數(shù)據(jù)資源所能帶來的應(yīng)用價值。
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XRD表示什么意思,由XRD圖譜怎么分析物質(zhì)結(jié)構(gòu)?
首先簡單說下原理——
角度θ為布拉格角或稱為掠射角。關(guān)于XRD的測量原理比較復(fù)雜,要知道晶體學(xué)和X射線知識。簡單的來說(對粉末多晶):當單色X射線照射到樣品時,若其中一個晶粒的一組面網(wǎng)(hkl)取向和入射線夾角為θ,滿足衍射條件,則在衍射角2θ(衍射線與入射X射線的延長線的夾角)處產(chǎn)生衍射。
但在實際應(yīng)用中,我們只需用儀器做出XRD圖譜,然如肆后根據(jù)pdf卡片來知道所測物質(zhì)的種類,和結(jié)構(gòu)。pdf卡片是
X射線衍射
化學(xué)分析聯(lián)合會建渣信轎立的物質(zhì)的衍射數(shù)據(jù)庫。他們制備了大量的物質(zhì),使用者只要把自己的圖譜和標準圖譜對比就能知道自己的物質(zhì)種類及結(jié)構(gòu)。隨著
計算機技術(shù)
的發(fā)展,現(xiàn)在都是通過導(dǎo)入研究者測試得到的XRD圖譜,電腦軟件(如Jade)通過匹配度尋找與之比配的pdf卡片,很方便。
在XRD中,不僅可以定性得到物質(zhì)的種類,相結(jié)構(gòu)。而且可以通過
謝樂公式
得到晶粒尺寸以及通過精修手段得到
晶胞
常數(shù)。
實際操作過程中,一坦頃般都能得到一個XRD的測試圖譜,在你盡可能提供多的信息情況下,比如物相的制備方法,所包含的元素等,與標準卡片對比,找到跟你XRD圖譜一樣的標準圖譜,再分析,當然得到的結(jié)果中可能有多種物相,那樣你就得根據(jù)你圖譜上的峰的位置一條一條地去找卡片庫,匹配,然后就OK了
XRD是X射線衍射猛山分析
XRD圖譜用來分析無機化合物的結(jié)構(gòu)。通過XRD可以知道物質(zhì)中所含并磨的元素,以及元素的化合價,還可以通過相關(guān)的計算,得出該物質(zhì)的空間絕知斗點陣
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