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EMBOSS是一款用于生物信息學數(shù)據(jù)分析的免費軟件包，它具有強大的特性和功能，能夠幫助生物信息學家進行多樣的數(shù)據(jù)分析。在這篇文章中，我們將介紹如何在Linux上安裝EMBOSS。
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步驟1：下載EMBOSS
我們需要在EMBOSS官方網(wǎng)站上下載軟件包，網(wǎng)址為http://emboss.sourceforge.net。在網(wǎng)站的左側側邊欄中，可以看到“Download”和“Tarball”兩個鏈接。我們需要點擊“Tarball”鏈接，下載最新版本的EMBOSS安裝包。
步驟2：安裝依賴項
在安裝EMBOSS之前，我們必須先安裝一些必要的依賴庫和工具。具體而言，我們需要安裝以下軟件包：
– GCC編譯器
– GNU Automake
– GNU Autoconf
– Zlib開發(fā)庫
我們可以使用每個Linux發(fā)行版的軟件包管理器來安裝這些軟件包。比如，在Ubuntu上，我們可以使用以下命令來安裝這些軟件包：
sudo apt-get install gcc automake autoconf zlib1g-dev
步驟3：解壓縮EMBOSS安裝包
我們需要將下載的EMBOSS安裝包解壓縮到一個目錄中。在終端中切換到下載的EMBOSS安裝包所在的目錄，然后使用以下命令來解壓縮：
tar -xvf emboss-latest.tar.gz
這將在當前目錄下創(chuàng)建一個名為“emboss-X.X.X”（其中“X.X.X”代表EMBOSS的版本號）的新目錄，里面包含了EMBOSS的源代碼。
步驟4：編譯和安裝EMBOSS
現(xiàn)在，我們需要切換到剛剛解壓縮的EMBOSS目錄，并開始編譯和安裝。在終端中輸入以下命令：
cd emboss-X.X.X
./configure –prefix=/usr/local/emboss
make
sudo make install
這幾個命令將會：
– 進入到EMBOSS目錄
– 配置安裝選項
– 編譯軟件包
– 安裝軟件包
上述第3步和第4步需要一段時間才能完成，具體時間取決于你的電腦處理器性能和內存大小。
步驟5：測試EMBOSS
現(xiàn)在，EMBOSS已經(jīng)安裝完畢，我們可以通過運行以下命令來測試它：
which emboss
如果輸出如下，則說明EMBOSS已經(jīng)成功安裝：
/usr/local/emboss/bin/emboss
步驟6：使用EMBOSS
EMBOSS安裝完畢后，我們可以通過終端或調用腳本等方式進行操作。例如，你可以使用以下命令來查看EMBOSS的版本號：
embossversion
更多的EMBOSS使用方式和命令，請訪問官方文檔網(wǎng)站。
在Linux上安裝EMBOSS是一項容易的任務，只需要遵循上述步驟，就可以輕松地安裝它。EMBOSS是一款強大的生物信息學數(shù)據(jù)分析軟件，它的安裝可以幫助我們更好地處理生物信息學數(shù)據(jù)。
相關問題拓展閱讀：
- 求助，我在安裝EMBOSS遇到問題
- 請教個emerge失敗的問題
求助，我在安裝EMBOSS遇到問題
在程序管理里面 可以查看到是否有安裝支付寶的安全控件 如果它已經(jīng)提示你了，就代表你已經(jīng)安裝過 你使用IE瀏覽器來購買東西即可
請教個emerge失敗的問題
昨天升級時發(fā)現(xiàn)n個包都報同一個錯誤：
libtool: compile: Failed to create `.libs’
make: Error 1
make:Waiting for unfinished jobs….
libtool: compile: Failed to create `.libs’
make: Error 1
libtool: compile: Failed to create `.libs’
make: Error 1
make: Leaving directory `/var/tmp/portage/app-text/poppler-0.10.4/work/poppler-0.10.4/goo’
make: Error 1
make: Leaving directory `/var/tmp/portage/app-text/poppler-0.10.4/work/poppler-0.10.4′
make: Error 2
看了看，我猜測可能是libtool有問題，于是打算從新emerge一下libtool，但是發(fā)現(xiàn)它也報錯
Assembler messages:
Fatal error: can’t create libltdl/.libs/libltdl_libltdl_la-lt__alloc.o: No such file or directory
make: Error 1
make:Waiting for unfinished jobs….
Assembler messages:
Fatal error: can’t create libltdl/.libs/libltdl_libltdl_la-lt_dlloader.o: No such file or directory
Assembler messages:
Fatal error: can’t create libltdl/loaders/.libs/libltdl_libltdl_la-preopen.o: No such file or directory
然后想也不想的就要從新emerge gcc。。。沒想到它更離譜，報如下錯誤：
configure: creating ./config.status
mkdir: cannot create directory `conf4892.dir’: File exists
config.status: creating Makefile
config.status: creating mkheaders.almost
config.status: creating config.h
make: Leaving directory `/var/tmp/portage/sys-devel/gcc-4.3.3/work/build’
make: Error 2
make: Leaving directory `/var/tmp/portage/sys-devel/gcc-4.3.3/work/build’
make: Error 2
我找到這個文件，刪除了。從新emerge又報了一個類似的錯誤。刪除所有臨時文件，又從新下載了gcc的包，后還是不能解決。
我的emerge －－info如下：
Portage 2.1.6.7 (hardened/linux/amd64/2023.0/desktop, gcc-4.3.3, glibc-2.9_pr1, 2.6.28-gentoo-r2 x86_64)
=================================================================
System uname:
Timestamp of tree: Thu, 26 Feb:35:01 +0000
ccache version 2.4
app-shells/bash: 3.2_p48-r1
dev-lang/python: 2.5.4-r2
dev-util/ccache: 2.4-r8
dev-util/cmake: 2.6.2
sys-apps/baselayout: 2.0.0
sys-apps/openrc: 0.4.3-r1
sys-apps/sandbox: 1.3.8
sys-devel/autoconf: 2.13, 2.63
sys-devel/automake: 1.5, 1.7.9-r1, 1.9.6-r2, 1.10.2
sys-devel/binutils: 2.19.1
sys-devel/gcc-config: 1.4.1
sys-devel/libtool: 2.2.6a
virtual/os-headers: 2.6.28-r1
ACCEPT_KEYWORDS=”amd64 ~amd64″
CBUILD=”x86_64-pc-linux-gnu”
CFLAGS=”-march=core2 -O2 -pipe -fforce-addr”
CHOST=”x86_64-pc-linux-gnu”
CONFIG_PROTECT=”/etc”
CONFIG_PROTECT_MASK=”/etc/ca-certificates.conf /etc/env.d /etc/fonts/fonts.conf /etc/gconf /etc/gentoo-release /etc/revdep-rebuild /etc/sandbox.d /etc/terminfo /etc/udev/rules.d”
CXXFLAGS=””
DISTDIR=”/usr/portage/distfiles”
EMERGE_DEFAULT_OPTS=” –keep-going”
FEATURES=”ccache distlocks fixpackages keepwork parallel-fetch protect-owned sandbox sfperms strict unmerge-orphans userfetch”
GENTOO_MIRRORS=”
”
LANG=”zh_CN.UTF-8″
LDFLAGS=”-Wl,-O1″
MAKEOPTS=”-j3″
PKGDIR=”/usr/portage/packages”
PORTAGE_RSYNC_OPTS=”–recursive –links –safe-links –perms –times –compress –force –whole-file –delete –stats –timeout=180 –exclude=/distfiles –exclude=/local –exclude=/packages”
PORTAGE_TMPDIR=”/var/tmp”
PORTDIR=”/usr/portage”
PORTDIR_OVERLAY=”/usr/local/portage/layman/gentoo-china”
SYNC=”
USE=”X a52 aac aalib acl acpi alsa amd64 apm audiofile bash-completion berkdb bluetooth branding bzip2 cairo cddb cdparanoia cdr cjk cli cracklib crypt css dbus dri dts dv dvd dvdr dvdread eds emboss encode esd evo exif fam fbsplash ffmpeg firefox flac gdbm gif glade gpm gstreamer gtk hal hardened iconv immqt-bc isdnlog jpeg justify lame laptop ldap libnotify live mad midi mikmod mmx mng mp3 mpeg mudflap multilib ncurses nptl nptlonly ogg openal openexr opengl openmp pam pcre pdf perl pic png ppds pppd python qt3support quicktime readline reflection samba sdl session spell spl sse sse2 sse3 ssl startup-notification subversion svg symlink sysfs tcpd theora tiff truetype unicode urandom u v4l v4l2 vcd vim-syntax vorbis wifi wma wmf x264 xml xorg xpm xscreensaver xulrunner xv xvid xvmc zlib” ALSA_CARDS=”ali5451 als4000 atiixp atiixp-modem bt87x ca0106 cmipci emu10k1x ens1370 ens1371 es1938 es1968 fm801 hda-intel intel8x0 intel8x0m maestro3 trident u-audio via82xx via82xx-modem ymfpci” ALSA_PCM_PLUGINS=”adpcm alaw asym copy dmix dshare dsnoop empty extplug file hooks iec958 ioplug ladspa lfloat linear meter mmap_emul mulaw multi null plug rate route share shm softvol” APACHE2_MODULES=”actions alias auth_basic authn_alias authn_anon authn_dbm authn_default authn_file authz_dbm authz_default authz_groupfile authz_host authz_owner authz_user autoindex cache dav dav_fs dav_lock deflate dir disk_cache env expires ext_filter file_cache filter headers include info log_config logio mem_cache mime mime_magic negotiation rewrite setenvif speling status unique_id userdir usertrack vhost_alias” ELIBC=”glibc” INPUT_DEVICES=”keyboard mouse synaptics evdev” KERNEL=”linux” LCD_DEVICES=”bayrad cfontz cfontz633 glk hd44780 lb216 lcdm001 mtxorb ncurses text” USERLAND=”GNU” VIDEO_CARDS=”radeon”
Unset: CPPFLAGS, CTARGET, FFLAGS, INSTALL_MASK, LC_ALL, LINGUAS, PORTAGE_COMPRESS, PORTAGE_COMPRESS_FLAGS, PORTAGE_RSYNC_EXTRA_OPTS
關于linux安裝emboss的介紹到此就結束了，不知道你從中找到你需要的信息了嗎 ？如果你還想了解更多這方面的信息，記得收藏關注本站。
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新聞標題：如何在Linux上安裝EMBOSS？(linux安裝emboss)
文章地址：http://m.fisionsoft.com.cn/article/dhsesip.html
