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linux上安裝了BLAST:快速、容易、便捷

BLAST(快速最佳搜索工具)是一款用于生物序列比對的非常有用的應(yīng)用程序。安裝了BLAST有助于用戶更加快速、容易、便捷地訪問和比較生物信息。它可以幫助用戶以更快的速度找到某一特定序列,從而發(fā)現(xiàn)分析DNA、RNA和蛋白質(zhì)等生物學(xué)數(shù)據(jù),簡化了分析流程并加快分析結(jié)果的獲得。
在Linux上安裝了BLAST過程非常簡單,不需要復(fù)雜的設(shè)置,只需要下載并安裝了BLAST的源代碼即可;基本的安裝過程可以簡單概括如下:
1.下載BLAST源代碼:
wget http://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.10.0/ncbi-blast-2.10.0+-src.tar.gz
2.解壓源代碼:
tar -zxvf ncbi-blast-2.10.0+-src.tar.gz
3.進(jìn)入解壓后的路徑:
cd ncbi-blast-2.10.0+-src
4.編譯:
./configure
make
make install
完成后,只需在終端中輸入以下命令即可打開BLAST:
“`bash
blastn -help
安裝完成后,建議用戶配置一個blast運(yùn)行環(huán)境,讓它可以從任何路徑訪問,可以在~/.bashrc文件中加入一行: ```bash export PATH=$PATH:/usr/local/ncbi/blast/bin
上面的步驟可以讓用戶在Linux上更加快速、容易、便捷地安裝了BLAST,Linux上BLAST應(yīng)用也會變得更加便捷,同時也有助于用戶發(fā)現(xiàn)并分析生物學(xué)信息。
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