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隨著信息技術(shù)的迅猛發(fā)展,我們可以輕易地獲取和存儲(chǔ)大量的數(shù)據(jù)。然而,隨著數(shù)據(jù)量的增加和數(shù)據(jù)類型的復(fù)雜性,現(xiàn)有的存儲(chǔ)技術(shù)面臨著更高的挑戰(zhàn)。在過(guò)去幾十年中,我們已經(jīng)見(jiàn)證了磁盤、光盤、固態(tài)硬盤、云存儲(chǔ)等技術(shù)的發(fā)展。然而,這一切可能在不久的將來(lái)都將過(guò)時(shí)。近年來(lái),核磁數(shù)據(jù)存儲(chǔ)技術(shù)已經(jīng)開(kāi)始逐步成為未來(lái)數(shù)據(jù)庫(kù)的新紀(jì)元。

成都創(chuàng)新互聯(lián)公司服務(wù)項(xiàng)目包括運(yùn)河網(wǎng)站建設(shè)、運(yùn)河網(wǎng)站制作、運(yùn)河網(wǎng)頁(yè)制作以及運(yùn)河網(wǎng)絡(luò)營(yíng)銷策劃等。多年來(lái),我們專注于互聯(lián)網(wǎng)行業(yè),利用自身積累的技術(shù)優(yōu)勢(shì)、行業(yè)經(jīng)驗(yàn)、深度合作伙伴關(guān)系等,向廣大中小型企業(yè)、政府機(jī)構(gòu)等提供互聯(lián)網(wǎng)行業(yè)的解決方案,運(yùn)河網(wǎng)站推廣取得了明顯的社會(huì)效益與經(jīng)濟(jì)效益。目前,我們服務(wù)的客戶以成都為中心已經(jīng)輻射到運(yùn)河省份的部分城市,未來(lái)相信會(huì)繼續(xù)擴(kuò)大服務(wù)區(qū)域并繼續(xù)獲得客戶的支持與信任!
核磁共振(NMR)是一種廣泛應(yīng)用于生物化學(xué)、材料科學(xué)、醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域的基礎(chǔ)技術(shù)。不同于傳統(tǒng)的電子計(jì)算機(jī),核磁數(shù)據(jù)存儲(chǔ)利用的是原子的磁性來(lái)存儲(chǔ)信息。在這種技術(shù)中,信息是通過(guò)將數(shù)字編碼為核磁共振譜中的不同峰來(lái)存儲(chǔ)的。這種特殊的峰可以被探測(cè)到并被解碼為數(shù)字信號(hào),從而存儲(chǔ)和檢索信息。
與傳統(tǒng)存儲(chǔ)技術(shù)相比,核磁數(shù)據(jù)存儲(chǔ)具有許多優(yōu)勢(shì)。它可以存儲(chǔ)大量數(shù)據(jù)。目前,核磁存儲(chǔ)技術(shù)可以在一個(gè)晶體中儲(chǔ)存超過(guò)10TB的數(shù)據(jù),這相當(dāng)于幾百萬(wàn)部電影或幾百億頁(yè)的文本。這種技術(shù)的存儲(chǔ)密度非常高。相較于傳統(tǒng)磁盤,核磁數(shù)據(jù)存儲(chǔ)器的存儲(chǔ)密度高了10-1000倍。核磁數(shù)據(jù)存儲(chǔ)也具有極高的速度和穩(wěn)定性,實(shí)現(xiàn)了無(wú)損的數(shù)字信息存儲(chǔ)和檢索。
當(dāng)然,這種新穎的技術(shù)也存在一些挑戰(zhàn)。其中更大的挑戰(zhàn)之一是成本。盡管這項(xiàng)技術(shù)可以儲(chǔ)存大量信息,但它也需要依賴高端設(shè)備和精細(xì)的技術(shù)實(shí)現(xiàn)。目前,核磁數(shù)據(jù)存儲(chǔ)技術(shù)仍然存在很高的成本。因此,除了技術(shù)本身的推進(jìn),了解成本控制和降低的重要性也是關(guān)鍵所在。
然而,核磁數(shù)據(jù)存儲(chǔ)技術(shù)的發(fā)展仍在繼續(xù)。從實(shí)驗(yàn)室到實(shí)際的應(yīng)用場(chǎng)景,這種技術(shù)正在逐漸向著商業(yè)化邁進(jìn)。諸如IBM等公司正在積極地投入資源,并與科研團(tuán)隊(duì)合作,探究更廣泛的應(yīng)用和更廣泛的存儲(chǔ)場(chǎng)景。
隨著數(shù)字化的加速發(fā)展,核磁數(shù)據(jù)存儲(chǔ)已經(jīng)成為了一個(gè)備受關(guān)注的領(lǐng)域。從多媒體文件到科學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),它都成為了未來(lái)數(shù)字化存儲(chǔ)的有力候選。如果成本控制有效,核磁數(shù)據(jù)存儲(chǔ)技術(shù)將成為未來(lái)數(shù)據(jù)庫(kù)的新紀(jì)元,并且在多個(gè)領(lǐng)域中發(fā)揮著重要的作用。
成都網(wǎng)站建設(shè)公司-創(chuàng)新互聯(lián),建站經(jīng)驗(yàn)豐富以策略為先導(dǎo)10多年以來(lái)專注數(shù)字化網(wǎng)站建設(shè),提供企業(yè)網(wǎng)站建設(shè),高端網(wǎng)站設(shè)計(jì),響應(yīng)式網(wǎng)站制作,設(shè)計(jì)師量身打造品牌風(fēng)格,熱線:028-86922220什么是生物信息學(xué)中的二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)?
一、生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的種類
分子生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)種類繁多。歸納起來(lái),大體可以分為4個(gè)大類:
基因組數(shù)據(jù)庫(kù)
核酸和蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)
生物大分子(主要是蛋白質(zhì))三維空間結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)
由上述3類數(shù)據(jù)庫(kù)和文獻(xiàn)資料為基礎(chǔ)構(gòu)建的二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)
一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)(一次數(shù)據(jù)庫(kù)) :基因組數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)自基因組作圖,序列數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)自序列測(cè)定,結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)自X射線衍射和核磁共振等結(jié)構(gòu)測(cè)定。這些數(shù)據(jù)庫(kù)是分子生物學(xué)的基本數(shù)據(jù)資源,通常稱為基本數(shù)據(jù)庫(kù)、初始數(shù)據(jù)庫(kù),也稱一次數(shù)據(jù)庫(kù)。
二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)(二次數(shù)據(jù)庫(kù)) :是在一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)、理論分析的基礎(chǔ)上,衍生整理而得。它是根據(jù)生命科學(xué)不同研究領(lǐng)域的實(shí)際需要,對(duì)基因組圖譜、核酸和蛋白質(zhì)序列、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)以及文獻(xiàn)等數(shù)據(jù)進(jìn)行分析、整理、歸納、注釋,構(gòu)建具有特殊生物學(xué)意義和專門用途的數(shù)據(jù)庫(kù)。
一般說(shuō)來(lái),一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)量大,更新速度快,用戶面廣,通常需要高性能的計(jì)算機(jī)服務(wù)器、大容量的磁盤空間和專門的數(shù)據(jù)庫(kù)管理系統(tǒng)支撐。
二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)的容量則小得多,更新速度也不像一次數(shù)據(jù)庫(kù)那樣快,也可以不用大型商業(yè)數(shù)據(jù)庫(kù)軟件支持,這類針對(duì)不同問(wèn)題開(kāi)發(fā)的二次數(shù)據(jù)庫(kù)的更大特點(diǎn)是使用態(tài)判方便,特別適用于計(jì)算機(jī)使用經(jīng)驗(yàn)不太豐富的生物學(xué)家。
序列數(shù)據(jù)庫(kù)是分子生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)中最基本的數(shù)據(jù)庫(kù),包括核酸和蛋白質(zhì)兩類,以核苷酸堿基順序或氨基酸殘基順序?yàn)槎撮]培基本內(nèi)容,并附有注釋信息。
GenBank:由美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)建立()。該中心隸屬于美國(guó)國(guó)家醫(yī)學(xué)圖書(shū)館,位于美國(guó)家衛(wèi)生研究院(NIH)內(nèi)。
EMBL:由歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(European Molecular Biology Laboratory, 其下有European Bioinformatics Centre)建立(1982),主要位于英國(guó)劍橋Cambridge和德國(guó)漢堡Hamburg。
DDBJ:日本DNA數(shù)據(jù)庫(kù)(DNA Data Bank of Japan)。由the National Institute of Genetics建立(), NIG主管。
二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)的形式:大多以web界面為基礎(chǔ),具有文字信息、表格、圖形、圖表等方式顯示數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)納唯容。
一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)與二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)之間并無(wú)明確的界限。(例如:GDB、AceDB、SCOP、CATH等都已經(jīng)具有二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)的特色)。
根據(jù)需要從一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)中搜集對(duì)象的相關(guān)數(shù)據(jù)而成的就是二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)。
像genebank,EMBL這種都是不加選擇的一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù),只要是實(shí)驗(yàn)獲得的,不管什么東西的序列,哪怕是不完整的序列都能上傳,而且它們的數(shù)據(jù)也有可能有重復(fù)。如果有某個(gè)人專門研究細(xì)菌的鑒定,需要用旦櫻爛到正式被認(rèn)可的16srDNA序列,為了研究方便,把這些一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)的各個(gè)種類細(xì)菌的公認(rèn)標(biāo)準(zhǔn)16srDNA序列的數(shù)據(jù)進(jìn)行整理模漏,重新構(gòu)建了一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù),這就是所謂的二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)。如果不構(gòu)建,直接用一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)做blast,就會(huì)得出很多未被承認(rèn)甚至不完整的序列,還要人工一個(gè)個(gè)看過(guò)去,找出公認(rèn)的標(biāo)準(zhǔn)序列,這樣就很麻煩。我舉得頌卜例子在現(xiàn)實(shí)中就是韓國(guó)的EzTaxon。
北京大學(xué)巖陪局生物信息中心有相關(guān)信息介紹,粗讓請(qǐng)參見(jiàn)鏈接亂慶
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